遙かな未来、異世界の文明に触れた人類は進化し、分化した。進化の末、巨大な宇宙船となった人類種「ジーンライナー」。最速のジーンライナーに、ジーンメジャーと身分を偽り乗り込んだオルス・ブレイクは、先輩のノーマ・クイックに、ジーンマイナーの遺伝子特異体であることを見破られる。しかし、その事実は隠されたまま、オルスは最新鋭の戦闘マシン「シェル」に搭乗する。種の進化に翻弄される、オルスたちの未来は。