怪獣に蹂躙されるがままだった人類は２０３９年のオペレーション・エターナルライトでヨーロッパを奪還、つかの間の勝利に酔いしれた。しかし２０４２年にゴジラが再び姿を現し、更なる絶望の日々が始まる。星をも砕くゴジラの力に対抗しうるのは、異星のテクノロジーによって開発された巨大兵器“メカゴジラ”のみ。果たして決戦の行方は！？-アニメ映画版ＧＯＤＺＩＬＬＡの知られざる前史を描く渾身の小説版第２弾！