Ｕ．Ｃ．００９７-。『ラプラスの箱』が開かれて一年。消息不明となっていた“ユニコーンガンダム”３号機が、再びその姿を見せ始めた。金色の“不死鳥”…その名は、“フェネクス”。“フェネクス”捕獲のため動くルオ商会特別顧問、ミシェルと“ナラティブガンダム”のパイロット、ヨナ。かつてコロニー落としを予見し、“奇蹟の子供たち”と呼ばれた二人だが“奇蹟の子供たち”には三人目がいた…。時代に翻弄され続けた彼らが最後に辿り着いた先はー。宇宙世紀シリーズ最新作映画「機動戦士ガンダムＮＴ」の脚本をもとに完全書き下ろし！三人の知られざる過去が明かされる小説版！