ついに巨大地震が東京を襲い、富士火山帯の火山が相次いで噴火。対応に追われる日本政府は、海外に国民を移住させようと、密かに交渉を進めていた。一方、田所博士が中心となって立ち上げた「Ｄ計画」の一員となった小野寺は、潜水艦で海底の調査を行う日々を送っていた。ある日、防衛庁にある計画本部の総務室で、「日本列島は沈没する！？」という見出しがついた週刊誌を目にしー。日本はどうなるのか！？全国民必読のベストセラー。