最強最後の有人機動兵器ガンヘッド・プロトゼロ略奪作戦を、一部の仲間の裏切りから失敗した私設警察官ライナー・真島は、多くの仲間を失いながらもひとり故郷東地区に辿り着いた。しかしそこはかつての喧騒とした懐しい街並ではなく、夥しい瓦礫広がる廃墟と化していたのだ。そしてそこで生活していた全ての人々もデス・ナンバーと呼ばれ拘留されていた。誰の意志で、何の為に、なぜ…？激しく燃え上る憤怒を持ってライナー・真島よ、再び立ち上れ！映画化に先駆け、真の英雄伝説、ガンヘッド誕生篇ここに完結。