研究所で働く母親と一緒に夏休みをすごすため、山の中にある村に来た妖怪好きの少年・淳史は、ヒマつぶしに村はずれの廃屋を訪れた。「妖怪がいるといいなあ」そう思った瞬間、豆富小僧は、ぽん、とその場にわいたのだった！淳史を追って外に出た小僧は、いろいろな妖怪たちと出会う。一方淳史は謎の組織・ＦＦ団により誘拐されてしまう！大騒動に、どうする小僧！？