竜崎知絵と虎ノ門夕姫。ともに十一歳で、誕生日はひと月ちがい。子どもなのに天才科学者の知絵。冒険家のお父さんのおかげで、大人顔負けの格闘術やサバイバル術を身につけている夕姫。ふたりは科学の力で地球の平和と正義を守る“キャンディ”だった！夏休みのある日のこと、子どもらしく遊園地を楽しんでいた、ふたりの目の前で、お忍びで来ていた外国の王子が誘拐された。悪人をこらしめ、王子を救い出そうとする“キャンディ”だったが、そこには複雑な事情が…いつしかふたりは、ふたつの国の戦争に巻き込まれてゆく。