“ディープス”は過酷な世界だった。ウィルはサバイバーたちと出会い、仲間になるが、レベッカ率いる兵士に追いつめられる。ひとり発掘にのめりこむバロウズ博士。そして、殺人ウイルス計画があきらかに…。