僕、藤山ナオトは、道野小学校の４年生。ある日、友だちのサクラ、アユム君と、図書室で信じられないものを見てしまったんだ…。きみょうな生き物、ミステリーサークル、あやしい男、そして宇宙人！？この世のなぞと不思議がうずまく「ムー」の世界がいま、はじまるー。