小沢治三郎提督率いる「第一機動航艦」は、真珠湾内の米太平洋艦隊司令部を壊滅することに成功し、米空母の『エンタープライズ』『レキシントン』を撃沈した。ウオッゼ沖海空戦でも『ホーネット』と『ヨークタウン』を撃砕し、セイロン島沖で「英極東艦隊」の空母三隻や旧式戦艦などを殲滅、ついにインド洋の西部とペルシャ湾岸を制圧する。しかし、米国の圧倒的な工業力と資源力を見据えた山本五十六は、今こそ米海軍を徹底的に叩く時であると決意し、最終決戦に打って出る。それはドイツから取り入れた新兵器を使ってパナマ運河を爆砕し、ハワイの真珠湾を占領するという壮大な作戦であった。果たして『夢幻の艦隊』は、最後に勝利を手中にすることができるのか。