米太平洋艦隊を一度は迎撃した日本だが、覇権国を標榜するアメリカは再び空母戦闘群を進出させ、太平洋での日米激突は避けられないことになった。その頃、欧州諸国は突如反米姿勢を打ち出し、ＮＡＴＯ軍が在欧米軍を攻囲。さらにロシア軍が中国へ進攻し、ＮＡＴＯ諸国へ急接近を始めた。そんな形勢不利のアメリカに、何者かがミサイルが撃ち込み、世界が核戦争に突入する。ついに日本も戦略原潜「大和、武蔵、長門」を出撃させるが…。