暗黒卿、かくして誕生すー。クローン大戦から３年後。銀河共和国と分離主義勢力の対立は激化し、全銀河で激闘を繰り広げていた。そんな中、最高議長パルパティーンが分離主義勢力軍によって捕らわれてしまう。オビ＝ワンとアナキンは救出に成功するが、アナキンは無抵抗のドゥークー伯爵の首をはね、ジェダイの掟を逸脱してしまう。帰還したアナキンを待っていたのは妻パドメの妊娠の報告だった。しかしアナキンは、出産の際にパドメが命を落とす予知夢にうなされる。母を救えなかった後悔から、アナキンはパドメを救うためにさらなる強大な力を欲するようになる。ジェダイ・マスターへの昇格を認められず、不満を募らせるアナキンに、闇の力の恐るべき誘惑がー。