東せつながラビリンス再建のために去ってから１年後、桃園ラブ、蒼乃美希、山吹祈里は中学３年生になっていた。３人は、それぞれ将来の夢に向かってがんばっている。ところが、平和と思われた人々の生活を魔の手がおびやかしはじめ、突如あらわれた化け物に四つ葉町は大パニックに。逃げまどう人々を見て３人は再びフレッシュプリキュアに変身する。しかし、その魔の手の正体は…！？