あの瑠璃丸が帰って来た。ごくフツーの女子高生・竜造寺翔子が、瑠璃丸たち忍者家族と出会ってはや１年。慣れない東京で忍者たちが巻き起こす大騒ぎ、敵対する忍者群の出現、そして戦い…。様々な出来事は、忍者家族の結束を固め、翔子にとっても彼らは大切な仲間となっていた。そして、東京で迎える２度目の元旦。平和な正月を過ごす瑠璃丸たちの前に、霧隠才蔵の子孫・蘭蔵が突然現れる。それが、新たなドラマの始まりだった…。松枝蔵人がシリーズ初の書き下ろしで贈る平成忍者ストーリー。ついに第２部開幕。