フィリピン諸島を占領し蓬莱島を狙うスミノフ軍・蓬莱軍の救援要請に、海中戦艦玄海を旗艦とする列島軍艦隊は比島沖へ進出。マニラ湾に集結するスミノフ大艦隊に対し、山本陽六司令官の豪胆な奇襲作戦が発動される。一方、スミノフは北九州上陸軍に水陸両用のホバークラフト戦艦を投入、列島軍の防衛線を突破して一気に有明海まで達した。危うし日本列島。