炭鉱の町で暮らす少年パズーはある日空から降りてきた少女シータを助ける。謎の鉱石“飛行石”を持つシータを狙う国防軍や海賊たち。数々の試練を乗り越え、伝説の空中都市ラピュタを目指す大冒険が今始まるー。スタジオジブリ設立後、記念すべき第１作となった名作アニメーションが、完全新編集の文庫コミックで鮮やかに甦る。