修道院で育った天涯孤独の美少女・山崎紫苑は、完璧な殺人マシーン。神の名の下に組織に純粋培養され、政府の要人らを始末する日日を過ごしていた。そんなある日、完全防備のはずのマンションの部屋に何者かが侵入し、殺されかける。さらに好意を寄せていた管理人も、実は紫苑を狙う暗殺者であった。いったいなぜ。不安と絶望のさなか、偶然出会ったフリーのカメラマン・伊東から、初めて現実世界を知らされる。伊藤を愛するようになり、自我が芽生えた紫苑は、次第に組織と自分との存在に疑いを…。