帝国憲法が発布された年に生まれた南原繁は、やがて一高で新渡戸稲造、内村鑑三らの師や生涯の親友と出会い、学問とキリストの道へ。次第に軍国化してゆく日本は、政治学徒となった南原の人生や学問の砦・東京帝国大学にも暗い影を落とし始める。言論や研究の自由が脅かされ、教え子が次々と戦地へと送られる苦悩と絶望のなかで、南原は「最高善」を目指して格闘し続けるのだった…。戦後最初の東大総長・南原繁を描く歴史長編。