北町奉行・遠山景元の影同心、高見高斎、陣内辰馬、お連の三人と南町奉行・鳥居耀蔵の元に、塩漬けにされた人間の耳が届けられ、神田川と大川に首と両脚を切られたバラバラ死体が流れ着いた。この奇怪な事件で探りを入れていた海産物問屋「土佐屋」は皆殺しにされ、証拠となる女の生首を見つけた御家人・伊坂正泰の家も爆破されてしまう。景元と影同心は事件の背後に、恐ろしい謀が隠されていることを知る。