バディとして、恋人として、共に任務に当たり数々の窮地を脱してきたカイと三四郎。カイの義父で月行政長官であるドレイクが悲願とする『月独立』を目指し、かつての仲間たちと共に新たな任務に当たっていた二人だったが、互いに相手の心を理解できないまま、噛み合わない焦燥を抱えていた。そんな中、いよいよ作戦も佳境を迎えようとしたところで、カイが拉致されてしまいー！？『青の軌跡』シリーズ、完結巻！