美少女錬金術士登場！「３年の間に成果がない場合、このアトリエは取りつぶしになる」師匠であるアストリッドから突然に工房を任された。若き錬金術士、ロロナことロロライナ・フリクセル。アトリエの存続のため、なんとか仕事をこなす日々。あるとき、人々の錬金術への誤解を解くために王国祭で何かしてみないかという提案が上がる。仲間たちにも力を借り、舞台劇に決めたロロナ。だが、肝心の内容がなかなか決まらない。そんなとき、アストリッドからとある物語を教わる。『“偉大な錬金術士”のアトリエ』-どこか既視感を覚える内容に首を傾げつつもロロナたちは舞台成功に向けて動きはじめる。