「神が人を殺した。これは神々の殺人の始まりだ」連続殺人の刺殺体の上には、奇妙なメモが残されていた。捜査にあたった十津川警部は亀井刑事と共にメモを手がかりに出雲に向かう。そして祝島という無人島にたどりつき、島の神主の息子・神木洋介を連続殺人事件の容疑者と特定するが…。