１９８５年の現代に戻って来たマーティのもとに、未来へ旅立ったはずのドクが現れる。今度は未来のマーティの子どもに問題が起きているらしい。彼女のジェニファーも一緒にデロリアンに乗りこみ、３人は未来へと旅立った！しかし、マーティたちが未来へ行ったことで、あるべき１９８５年が大きく変わってしまう。はたして、マーティはあるべき現代を取り戻せるのか！？小学校中学年から。