宇宙空間での試験運転を終えて帰還の途にあったアメリカの超高性能無人宇宙船“ナイトホーク”が突如南太平洋上空で消息を絶った。捜索の応援要請を受けた国立海中海洋機関（ＮＵＭＡ）のオースチンは同機の着水地点と目されるガラパゴス諸島周辺海域へと急行するが、最先端テクノロジーの奪取を目論むロシアと中国も当該海域に艦船を集結させつつあった。工作員も暗躍しだす。南太平洋はにわかに風雲急を告げる。オースチンは両国を出し抜く秘策を繰り出すが、事態は思わぬ方向へと進んでいく。