本書は、上巻、下巻、補遺・索引の３巻に分冊した。上巻には、序説と第１編の天文１８年から第２編の天正２年に至る文書を収めた。下巻には、第２編の天正３年から第３編の同１０年に至る文書と年代未推定文書及びむすびを収め、花押集・印章集を附載した。本書では、信長の直状（書状・判物・朱印状・黒印状・消息）・起請文・条書・禁制・制礼・請取状・覚・銘文のほか、側近や部将・奉行等が、信長の意思を伝達し、あるいは施行するために発行した副（添）状・奉書・連署状・証文・折紙などをも信長文書の内に含め、それらに関連のある文書を〔附録〕とし、各文書名の冒頭に一連番号を附した。なお、以上の信長文書理解のために参考となる文書は〔参考〕として、各文書の末に掲げた。