昭和２０年ー。山本五十六率いる暫定自由日本政府・米国共同軍と日本軍の戦いは激化していた。日本軍はソ連軍の援助を得るが、米軍の圧倒的な物量の前に戦況は悪化していく。ルソン島で海軍航空隊の指揮を執る大西瀧治郎は悲壮な決意のもと神風特攻隊を設立。裏切った山本の乗艦する空母龍神を狙っていた。山本は無益な戦いを止めようと、大西に密書を送り、全てを明かし帰順を促すが決裂してしまう。山本は米軍とともに本土を目指し進攻を再開するが、大西瀧治郎一世一代の秘策が待ち構えていたのだ…。