白の書、カイネ、エミール。いつしか共に旅をするようになった仲間たちの協力を得ながら、青年ニーアは妹ヨナを連れ去った魔王を探し続けていた。『石版』『贄』『人魚姫』『狼の巣』『双子』-ヨナを取り戻すため、ニーアは世界の核心に迫っていく。『ＮｉｅＲ　Ｒｅｐｌｉｃａｎｔ　ｖｅｒ．１．２２４７４４８７１３９…“ゲシュタルト計画回想録”』後編。