アメリカ艦隊を迎撃する『あ』号作戦の完敗は、日本政府と軍に大きな衝撃を与えた。マリアナ諸島が米軍の手に落ち、さらに昭和１９年６月、北九州がＢ２９の爆撃を受けた。数カ月後にはサイパン、テニアンを飛び立ったＢ２９が大挙して日本本土を来襲する…。本土が焼け野原になるのを阻止するため、Ｂ２９対策が深刻な問題として浮かび上がってきた。海軍は空技廠を中心に軍・民・学の総力を集めて、ターボジェット発動機を搭載した戦闘機開発に邁進。Ｂ２９来襲の危機が迫る中、本土防衛の切り札となる震電戦闘機隊が誕生する！