第零航空戦隊司令官大西瀧治郎が指揮する潜水空母「潜龍」の独断行動によって、ミッドウェー沖海戦は日本側が辛勝し、島の占領を果たした。連合艦隊は空母「赤城」と「加賀」喪失という大きな代償を払ったが、現われた米空母三隻をすべて撃沈、米太平洋艦隊には「サラトガ」一隻を残すのみとなったのだ。だが、「潜龍」の機密保持のため発信者を伏せた電報を打たせた大西は、一航艦司令南雲忠一との間に溝を作ってしまう。二ヵ月後、新編連合艦隊は、米軍が本格的反抗に転じたガダルカナルへ出撃。だが、ソロモン海で敵と遭遇した南雲艦隊は、空母一隻を撃沈したものの航空隊の大半を失って後退を余儀なくされてしまう。一方「潜龍」は、輸送船団護衛に専念すべく戦闘機のみの搭載だった。攻撃兵力のない状態で米空母と対峙しなければならなくなった大西たちの運命は！？シリーズ第二弾。