昭和日本に時空転移した自衛隊は、圧倒的な兵力で帝都に迫るＢ２９大編隊を撃滅した。しかし今のままの日本では米国に負け、オーバーテクノロジーが世界に流出。果ては世界滅亡への道を突き進むと考えた令和の防衛大臣・崔麗華は、クーデターを起こして政権を奪取。対米戦必勝の作戦を実行に移す。そのための第一歩がサイパン攻略作戦だった。空挺部隊を含む日本の機動艦隊は一気に同島へ攻め入り、ここでも米軍に力の差を見せつける。一方、首相となった崔麗華は、早期戦争終結を実現するため秘密裏にある計画を進めていた。そんな中、突如、太平洋上に国籍不明の謎の戦艦が姿を現すのだった。時空の歪みの中で翻弄される日米艦隊は、新たな戦いへと突入する！