とある星では“ユル”と呼ばれる生命体が栄えていた。ユルはヒトとあまり変わらない姿をしているが、その背に生えた羽で飛行することができた。ヒトの数倍以上の寿命、高度な文明。その寿命の永さが悲劇の引き金となる。ユルが増えすぎて資源戦争が起きてしまったのだ。戦いに敗れた一部のユルは宇宙船に乗り旅に出た。そして見つけた地球を安息の地と見定め降り立つも、着陸した瞬間にユルの肉体と魂は分離してしまった。肉体は地球生物の姿形を真似た狂暴な生命体“アニマ”に変化し、魂は浮遊したあと石となり消えた。しかし分離を免れ、ユル本来の姿を保つ個体もいた。それらは天使と呼ばれ、ヒトビトに知識を与え導いた。ある時天使は、戦争に勝利したユルが地球侵略を企てていることを知る。そこで天使はヒトビトと共に侵略阻止を目的とする組織“ＲＯＧＨＡＩＮＮ”を結成したのであった。時は流れ２０ＸＸ年。幼小中高大一貫校“博明学院”に通う高校生の結城火花と小学生の貴音風早は、登校中に流れ星を見た。直後、波打つように世界が揺れ、多くの人が一瞬にして消えてしまった。その場に現れた水崎凛と土野ミシェルに導かれ避難先の学校へ向かったはずがそこには…！？