山下奉文陸軍中将を首班に、帝国陸海軍の有志やアジアの独立運動家たちによって組織された“大東亜艦隊”は、真珠湾奇襲部隊を吸収し、兵力を増強すると、ついには北海道を占領し、東条首相を捕え人質とした。彼らの目的は対米戦の阻止と、日本も含めた列強の支配からアジア諸国を独立させることだったが、叛乱軍撃破の命を受けた帝国海軍司令官・山本五十六は、連合艦隊を指揮するため、戦艦「大和」に乗り込んだ。