リドラーと名乗る悪の天才策士が、ウェイン産業から盗んだ技術を悪用してゴッサムの電力ネットワークを破壊し、全市民を暗黒の深淵へと叩き落とすと同時に、バットマンに対して挑戦状を叩きつけた！しかも、街を脅かす敵はリドラーだけではなかった。この闇の迷宮の中心には１匹の怪物…死の医師が潜んでいた。彼の奇怪な実験によって不気味に変容した死体が次々と発見され、警察はバットマンこそが犯人だと疑いはじめる。若き闇の騎士は警察からの追及を逃れつつ、リドラーの計画を解き明かし、ドクター・デスの大量虐殺を阻止しようと奮闘するが…。