彼らの襲来は、完全に予想外だった。世界の守護者たちが内輪揉めを続ける一方、暗黒の異次元から来た存在は姿を隠したまま、襲撃の機会を窺っていた。彼らの奇襲は成功し、ヒーローたちは惨敗した。ジャスティス・リーグは消え去り、その代わりにクライム・シンジケートが現れた。彼らはジャスティス・リーグの歪んだ鏡像であり、血も涙もない殺人鬼の集団だった。シンジケートの目標はただ一つ…この世界を支配すること。彼らはスーパーヴィランの軍団シークレット・ソサエティを引き連れて世界各地を侵攻し、抵抗する者を叩き潰した。彼らに抵抗できるヒーローはどこにもいなかった。もはや悪に対抗できるのは悪だけだ。ウルトラマンたちは、スーパーマンの宿敵であるルーサーを見くびった。彼こそが人類に残された最後の希望。侵略者を撃退するために、レックスは稀代の悪党を寄せ集め、さらに伝説のクライムファイターも味方に加える。戦争が始まる。悪の天才ＶＳ悪の超人。頭脳ＶＳ暴力。そして、この戦いは、さらなる巨悪を呼び覚ますことになる。戦争の結果がどうなろうと、最後に勝つのは…悪だ。