昼は家族思いの高校生、夜は壁を這う能力とスパイダーウェブで犯罪者たちと戦うクライムファイター。２つの顔を持つピーター・パーカーは、いつしか“クイーンズの親しい隣人”として、ニューヨークでは知られた存在になっていた。市民から愛されるヒーローとなっていたピーターだったが、キャプテンアメリカとアイアンマンの間で勃発した、アベンジャーズを引き裂く“内紛（シビルウォー）”に巻き込まれてしまった。アイアンマン側に立った彼を待ち受ける運命とは？映画『シビル・ウォー／キャプテンアメリカ』で初登場したマーベル・シネマティック・ユニバース版のスパイダーマンが、コミックでもついに始動！