数々の戦いを経て、つかの間の平穏を取り戻したゴッサムシティ。街を再建するために奔走するバットマンに、世界最強の傭兵デスストロークが襲いかかる！しかし、傭兵の襲来は大きな陰謀の序章に過ぎない。ゴッサムのヴィランたちによって闇に葬られた、街を落とす計画が動き出したのだった。アルフレッドも、ゴードンも失ったゴッサムで、バットマンは計画者を見つけだし、街を守り切ることができるのか？ジョーカーの新たな相棒パンチラインも登場し、物語は波乱の展開を迎える！