チェコ共和国の首都プラハ-この都市で、人類の未来を賭けたＣＩＡの囮作戦が進行していた。それは、アタッシュケース１個でマンハッタンを壊滅できるポータブル核爆弾＝ＰＮＢの売買。仲買人マイケル・ターナーの正体はＣＩＡきっての敏腕諜報員ケヴィン・ポープ、ＰＮＢのバイヤーとして姿を現したのは、ホワイトハウスの切り札と言われる伝説的ＣＩＡ諜報員ゲイロード・オークスだった。しかし、ターナーはミッション半ばにしてＰＮＢを狙うテロリストに殺されてしまう。なんとかして取引を成功させ、テロリストの手に渡る前にＰＮＢの破壊力を解除しなければ、人類は滅亡の危機にさらされる。取引の日まで、あと９日-ＣＩＡはついに苦渋の決断をする。