高校生エージェント・秋月凱と、そのパートナー・春日部弐華。二人の新たな赴任地は、はるか孤島にて戦争を教える高校・ミリタリオ学園だった。目的は、生徒会に監禁されているという“囚われの女神”の救出。硝煙の匂いと陰謀うずまく敵地で、二人は初めての単独行動を強いられる。そこで試されるのは、お互いへの信頼。そんななか、二人の関係に徐々に変化が現れてー。そして、最後に明かされる衝撃の真実。はたして“囚われの女神”の正体とは！？“ありえない学校”で繰り広げられる、ハイスクール・ラブ・ミッション第二弾。