さらわれたズキンからのメッセージは、三千億光年離れた場所から届いたものだった！？ズキンを救い出すべく、宇宙へ旅立つサモン＆ヒーロー部隊！しかし、彼らの前に、科学の壁が立ちふさがるのであった。カッコよく宇宙に旅立ちたいアサハカ隊長と、科学的に宇宙を目指す猫柳田博士。ようやく宇宙に飛び出してみれば、そこは地上の常識がまったく通用しない世界。三大ヒーローは、予想もしなかった苦闘を強いられる。宇宙からの侵略者ＶＳサモン＆ヒーローたちの戦いは、科学の壁を乗り越えて、さらに前巻から５年の歳月を乗り越えて、今始まるのだ。