世界を激震が襲った。一つの悲劇をきっかけに、合衆国政府は超人登録法を可決。全てのスーパーヒーローに対し、正体を明かすよう迫った。登録法への対処を巡って二つに割れたヒーロー達は、ついに苦渋の決断を下す。それは正義を志す者達が二手に分かれて相争うシビル・ウォー（内戦）への茨の道だった…。マーベルユニバースを、コミックスシーンを揺るがした、マーベルコミックス最大のクロスオーバー大作！君はどちらに付く？