免疫システムの中枢をなすＭＨＣ・ペプチドの相互作用、そのメカニズムの解明がここ数年のあいだに飛躍的に進められた。そして今、臨床医学への応用というテーマのもとに数々の研究成果が蓄積されつつある。ＭＨＣ・ペプチド複合体のしくみから、免疫応答・非応答に起因する疾病とその治療（自己免疫疾患、アレルギー、癌、感染症、移植など）までを最新の知見を交えて解説する。