昭和１８年４月、連合艦隊はガダルカナル攻防戦に勝利し、ソロモン海域から米国艦隊を駆逐し、制海権を掌握した。そんな折、司令長官・山本五十六を載せた陸攻がブイン上空で、Ｐ３８に撃墜された。指揮官を失った連合艦隊は、敵の圧倒的な物量作戦の前にじりじりと後退し、ついには硫黄島まで陥落する事態に。しかし、山本長官は生きていた。国葬まで行い、死んだと見せかけ、なんとドイツに渡り、ヒトラーと交渉の末、原爆の設計図を入手したのだ。三度生まれ変わった「大和」は、最終決戦の地、沖縄へ向かったが…。