東城大医学部に通う中学３年生の曾根崎薫が、同級生たちと洞穴で見つけた謎の生物“いのち”。世紀の大発見を知った文科省は、研究材料にしようと“いのち”を連れ去ってしまう。奪還を試みる薫たちだったが、やがて「こころの移植」をめぐる壮大な陰謀が明らかになり、米国政府をも巻き込む大騒動に発展していく。大人たちの理不尽や「組織」という得体の知れない敵に立ち向かう薫たちの奮闘が胸を打つ、中学生医学生シリーズ完結編！