影の交渉人という顔を持つ杏司は、忙しい合間をぬって学校へ。世話焼きな幼なじみ花菜とのことを同級生にからかわれたりと、平凡な日を過ごしていた。そんな時、本部より緊急メールが。それは影の外務大臣・安倍キヨアキの失脚を狙う者たちによるクーデターが発覚。学校ごと人質に取られたことを知らせる内容だった。杏司は大切な人たちを守るため、ひとり首謀者との交渉に臨むがー。神魔との運命をかけた交渉第２弾開始。