『ザ・デイ・ビフォア』-“ＳＡＯ”攻略のさなか、キリトはアスナにプロポーズし、二人は新婚生活を送ることに。だが新居に到着した二人が目にした光景は、思いがけないもので…？『ザ・デイ・アフター』-新生“ＡＬＯ”に新たなアバターでダイブして以来、アスナは謎の“離脱現象”に襲われていた。その原因は、“ＳＡＯ”時代に起こった一つの悲劇にあったー。『虹の橋』-海底神殿での冒険を終えたキリトたち。しかし海の王リヴァイアサンと深淵の王クラーケンの謎めいた会話は、一行を新たな冒険へといざなう！『Ｓｉｓｔｅｒｓ’Ｐｒａｙｅｒ』-“ＳＡＯ事件”のさなか、ある少女が医療用フルダイブ機器“メディキュボイド”の試作機に身を投じた。“絶剣”ユウキ、誕生の軌跡をここに。