中原の小国「永依」で破壊神と呼ばれる軍人に育ったラタは、大国火国との戦いにあけくれていた。火国から和睦の条件に自分の首を差し出せと要求され、策を練る。一方で、Ｎ県稗南郡稗南町の由宇という少女は、黒ずくめの男たちに襲われる。母親から「Ｘ-０１は人間が創り出した最も大きく、激しい恐怖」と教えられる。黒ずくめの男たちは、由宇に“覚醒”をもとめる。それが意味することとは…？