遥かな未来、人類は細菌兵器によって滅亡し、「神」と呼ばれる科学者に高い知能を与えられた二つの種族、猫族と犬族が血みどろの戦いを繰り広げていた。遺伝病の蔓延で絶滅の危機を迎えた猫族を救うために未来から送り込まれた猫、それがボギーだった。強力な戦闘力を持つボギーは、遺伝子操作の研究を進める香上博士の家に潜り込むが、博士が偶然造り出してしまった細菌をめぐって、凶悪な事件が続発。しかも、ボギーの目的を阻止しようと、未来から犬族の暗殺者が送り込まれてきた。