徳川幕府最後の改革が行われた天保年間、関八州取締役に任ぜられた北町奉行子息・遠山銀五郎は南町奉行息女・お燿と共に、坂東一円の遊侠鎮圧に乗り出す。配下選びの試合に千葉周作、男谷精一郎、島田虎之助ら名立たる剣客が集まった。「人間が人間らしく生きるのは乱世においてこそ…」とうそぶく謎の怪美童・南無扇子丸は、自らの交合によって他人と他人をとりつかせる妖術を用い、銀五郎達の行く手を阻む。