マイクロブラックホールを動力源とするらしい小惑星オシリス、人間の首を刎ねるパイプ状のロボット“チューバー”らによって、不気味な侵入を開始した未知の存在オビック。国立地域文化総合研究所（ＮＩＲＣ）の大沼博子らは、本格的な侵略を前に人類文明維持のための方策を探る。一方、小惑星オシリスに捕らわれた航空宇宙自衛隊一等空佐の宮本未生は、その内部で、同じく拉致されたという武山隆二と相川麻里の２人に出会う。