中国に姿を現した坂本龍馬を追い、ヘラクレス、沖田総司たちが駆ける。だが、龍馬は龍馬王となり、機械の神兵を率いて陰謀をめぐらせていた。総司は峰飛麟となり、ヘラクレスは龍馬王の臣下・燕子外である広円心となり神兵を追いつめるのだった。だが、水角という神兵を倒された仲間たちは広円心にせまる。危うく難を逃れた広円心は己の心を探り、龍馬王の宙空に浮く蜃城なる館を幻視する。その城の地下室には神の乗り物である龍馬号・トロイヤの木馬も存在しているのだ。いよいよ『刻謎宮２』の大完結が…。超伝奇巨篇。